El zoológico de Al Ain ha logrado un gran éxito en la creación de asociaciones y oportunidades de cooperación con una serie de instituciones que trabajan para la conservación de especies en peligro de extinción a nivel mundial.
Algunas de las principales asociaciones del zoológico son con Lewa Wildlife Conservancy, en Kenia; Marwell Wildlife, la Real Sociedad Zoológica de Escocia y Software de Gestión de Información Zoológica. Además, el zoológico trabaja con el Fondo de Conservación del Sahara, en Níger, para proteger a los animales que están en peligro de extinción por el pastoreo excesivo y la pérdida de hábitat.
Lisa Marie Banfield, jefa de Unidad de Desarrollo de Investigación de Conservación en el Departamento de Ciencias de la Vida, manifestó que "desde su fundación, Al Ain Zoo ha estado comprometido con los esfuerzos para proteger a los animales en peligro de extinción y ha participado en muchas iniciativas locales y globales para lograr este objetivo, a través de sus campañas y diversas actividades para concienciar al público sobre la importancia de preservar los animales en peligro de extinción".
"Trabajando en asociación con Lewa Wildlife Conservancy de Kenia, en 2014 el zoológico llamó a dos cachorros de león, nacidos recientemente en la reserva de Kenia, Yas y Delma. Estos felinos fueron equipados con collares de radio GPS suministrados a través del apoyo del zoológico de Al Ain para rastrear y monitorear sus movimientos y dietas. La asociación abarca una serie de especies en peligro de extinción, como los leones africanos, elefantes y rinocerontes".
